2001年第一届飞利浦全国大学生足球联赛开赛之际，球队第一次参赛就取得了第三名的成绩

2002年起，北京理工大学足球队连续三年获得飞利浦全国大学生足球联赛冠军。

2003年代表中国大学生足球队由名帅金志扬带队参加了在韩国举行的世界大学生运动会，球队不畏强手，取得了第七名的战绩。

2004年北京理工大学足球队还代表北京队参加了全国大学生运动会并获亚军，取得了北京在历届全国大运会上的最好成绩。

2005年球队虽然处在新老交替的阶段，但依然由金志扬率队再一次代表国家参加了在土耳其举行的世界大学生运动会。

2006年7月8日，北京理工大学足球队在沈阳再次获得李宁中国大学生足球联赛总冠军，这已经第四次获得全国联赛冠军。

2006年对于北京理工大学足球队来说是不平常的一年，在中国足协、中国大学生体育协会的大力支持下，作为惟一的一支纯粹的“学生军”首次参加了中国职业足球乙级联赛。

在第一阶段分区比赛中，北京理工大学足球队以10胜5平1负积35分的战绩高居北方赛区榜首，并提前一轮稳获北方赛区冠军，令所有乙级联赛的足球队刮目相看。

继而在10月底于重庆举行的乙级联赛的八强决赛中，北京理工大学先后战胜了宁波华奥、天津火车头、哈药毅腾队，一路高歌，直至夺取了2006年中国足协乙级联赛冠军，并同时取得了参加2007年中国足协甲级联赛的资格。

2007年7月25日，北京理工大学足球队在在广州大学城举行的第八届全国大学生运动会足球赛的决赛中，代表北京市大学生以1：0击败广东队，首次获得此项赛事全国冠军

在2007年中甲比赛的比赛中，北理工足球队以5胜7平积22分名列第十一位，取得了良好的社会反响。

在2008年中甲比赛的比赛中，北理工足球队以7胜7平积28分名列第七位，取得了更大的社会反响。