2000年，华坪县辖2个镇、9个乡。分别是：中心镇、荣将镇、文乐僳僳族乡、温泉彝族僳僳族乡、新庄僳僳族傣族乡、通达僳僳族乡、龙洞僳僳族乡、永兴僳僳族乡、船房僳僳族乡、石龙坝彝族傣族乡、大兴乡。

2005年，撤销龙洞僳僳族乡，其行政区域并入中心镇，中心镇政府驻地不变；撤销温泉彝族乡，其行政区域并入荣将镇，荣将镇政府驻地不变；

撤销文乐僳僳族乡和大兴镇，合并设立兴泉镇，新设立的兴泉镇政府驻原大兴镇政府驻地。2012年12月17日，华坪县石龙坝撤乡设镇，石龙坝乡撤乡设镇后，镇政府驻地及行政管辖范围不变。

华坪县属金沙江水系，境内有新庄河、乌木河两大河流。新庄河发源于华坪县通达乡乌坪子山南麓，由西北向东南穿行于华坪县境内，于塘坝河口附近汇入金沙江，全长68.9km，流域面积1240平方公里，多年平均水量6.56亿立方米，最大流量1170立方米/秒，最小流量0.6立方米/秒，多年平均流量15.28立方米/秒，全河总落差1307m。

主要支流有黑塘河、边凹河、良马河、民主河鲤鱼河、龙泉河和大兴河。