被沈若寒自我牺牲而救下的杨明远,因自责和害怕不敢向秦川承认自己的身份。但是秦川对党的忠诚,还有价值观感化了杨明远,杨明远决定振作起来,继续投身于革命事业,拯救国家。
秦川带着杨明远博士在郊外逃跑时与地下党碰头,不料这时星野美和也追踪至此,于是又是一场激烈的相互搏火。但是由于武器和人数上的劣势,秦川为了让杨明远等人能顺利逃脱,把敌军注意力都引到自己身上,当他把枪里的子弹打完后,便以淡然自若的姿态弃械投降。
这时,叶琳琳委托顾明杰查梅机关的细菌武器实验室所在地,也有了回复。叶琳琳按照地点,前往该处,打算为夏岚母子偷青霉素解毒,当是为秦川帮上一点忙。
在潜入藏有青霉素室,见日军的细菌武器研发专家菊田博士在实验室里面。叶琳琳要挟菊田给她拿出青霉素,而菊田就范后,趁叶琳琳不为意的时候,按响了警报,日军听见警报后,便往实验室冲去。
叶琳琳拿走青霉素,杀死了菊田博士之后逃跑。
星野美和见菊田博士被杀死,日军的细菌战可能受到影响,于是气上心头。秦川被星野美和捉到实验室,星野美和为了气秦川,故意在秦川面前打破青霉素,并威胁秦川,要他帮忙污染水源,然病菌扩散。
秦川见青霉素被美和越扔越少,于是心生一计,假装妥协,这时,秦川趁军日为他松绑时,以敏捷的身手,抽起敌人腰间的刀,连带杀死两人。
美和拔枪,与秦川在实验室进行一场恶战,但是最后以身手和智慧,还是秦川更胜一筹,于是毒妇星野美和如愿死在秦川手下。
这时梅机关的手下闻声赶来,也被秦川杀死。
秦川虽然逃脱,但是青霉素已毁,正当秦川绝望的时候,叶琳琳带着一批青霉素,交给了秦川。叶琳琳向秦川坦露自己心迹,让秦川好好爱家人,并祝福秦川,最后留下一封信给秦川,便不辞而别。
秦川带着青霉素回到家里,但是青霉素的剂量只够一个人使用。
两天后,阿灿因受到适当的治疗,回复健康,但是夏岚为了阿灿,把青霉素的剂量都给了自己儿子,正危在旦夕。这时,传来了日本投降的喜讯,在这段让人喜悦的消息中,夏岚释然地离开这个世界。
秦川悲喜交集,拥住身体还温热的妻子,在丧妻的悲伤中,迎接了新中国的美好篇章。