具体的保护措施如下：

保护大运河水质

大运河的水质是十分重要的，因为它是沿河两岸人们的水源，可是由于水质的恶化，很多河段的水都无法饮用。所以，需要对保护大运河的水质进行监控，提高大运河的水源质量。

禁止企业排放废水

大运河的水质问题，很大一部分原因是沿河的企业，随意排放废水废气，对大运河造成污染。所以，要禁止企业排放污水入河，并对违反规定的企业进行惩罚处理。

有限地旅游开发

现在很多城市都在搞开发和发展，大运河的旅游景点也相继出现。但是，在对大运河进行开发时，要合理有限地开发。

注意大运河的生态

大运河的生态系统是十分脆弱的，因为水质污染严重，而且人们也过度捕捞。所以，要关注大运河的生态环境。

行驶轮船使用清洁能源

在大运河河面上行驶的轮船，要尽可能使用新能源，清洁环保，不要对大运河造成生态破坏和环境污染。

在大运河两岸植树

可以在大运河的两岸植种树木，这样的话可以避免两岸土地留守，起到保持水土的作用。