1.常规Meta分析。常规Meta分析主要基于有对照组的直接比较的研究，最常见的是基于RCT的干预性Meta分析，此外，还有预后研究、动物实验、病因研究、基因多态性等的Meta分析。

2. 单组率的Meta分析。单组率的Meta分析只提供了一组人群的总人数和事件发生人数，不像其它类的Meta分析有两组人群，多为患病率、检出率、知晓率、病死率、感染率等的调查，基于的原始研究为横断面研究。

3. Meta回归分析还。在Meta分析时，需分析各研究间的异质性，并对异质性的来源进行探讨，Meta回归分析可评价研究间异质性的大小及来源。

一般认为，Meta回归分析是亚组分析的一种扩大，主要通过对多因素的效应量进行联合分析实现，仅当Meta分析纳入的研究数量在10个以上时才行此分析。

4. 累积Meta分析。

5.网状Meta分析。在临床实践中，若有一系列的药物可以治疗某种疾病，但RCT均是药物与安慰剂的对照，而药物互相之间的RCT都没有进行或很少，那么在这种情况下，就需要将间接比较和直接比较的证据进行合并，即行网状Meta分析。

6. 诊断性Meta分析。因地区、个体、诊断方法及条件的差异，使得发表的关于同一诊断方法的研究结果存在着不同甚至是矛盾的；