公共资源交易中心和行政服务中心不属同一系统，级别一般都在正处或副处级财政全额拨款事业单位，因为不是一个系统，所以没有上下级之说，关系话可能就是相辅相成的关系。

公共资源交易中心是负责公共资源交易和提供咨询、服务的机构，是公共资源统一进场交易的服务平台。属于事业单位。公共资源交易中心的内容包括工程建设招投标、土地和矿业权交易、企业国有产权交易、政府采购、公立医院药品和医疗用品采购、司法机关罚没物品拍卖、国有的文艺品拍卖等所有公共资源交易项目全部纳入中心集中交易。

行政服务中心原名行政审批服务中心，又叫政务服务中心，是集信息与咨询、审批与收费、管理与协调、投诉与监督于一体的综合性行政服务机构。

在我国，综合行政服务机构大都产生于本世纪初，尤其是《行政许可法》颁布前后。据有关统计资料，全国已有不同层级的综合行政服务机构3300多家，几乎覆盖了全国所有县市。

我国综合行政服务机构的产生，顺应了建设服务型政府的现实要求，是政府公共服务方式和服务程序的一种新的探索。其产生的原因大体可分为事实原因和法律原因。