选择培养基能够筛选你所需要培养的微生物，令其生长，其余微生物不生长。而鉴别培养基只能鉴别出你此种微生物是不是你所需要的微生物，而不能抑制其余种类的微生物生长。

这两个概念是有交叉的,不能彻底分开；

选择培养基是在培养基中加入某种化学物质,使之抑制某些细菌生长,而利于另一些细菌的生长,从而使后者从含有杂菌的标本中分离出.鉴别培养基主要用于分离并区分不同的细菌.

如副溶血弧菌常用的高盐培养基,可以抑制某些细菌的生长从而将其筛选出来。

是选择培养基,但也可以用它来区别细菌对盐的耐受性而鉴别细菌。

鉴别培养基：利用细菌分解糖类和蛋白质的能力及其代谢产物的不同，在培养基中加入特定的作用底物和指示剂，观察细菌生长过程中分解底物所释放的不同产物，通过指示剂的反应不同来鉴别细菌。

例如糖发酵管、克氏双糖铁琼脂（KIA）、伊红-亚甲蓝琼脂和动力-吲哚-尿素（MIU）培养基等。

选择培养基：在培养基中加入抑制剂，去抑制标本中的杂菌生长，有助于所选择的细菌种类的生长。例如培养肠道致病菌的SS琼脂，其中的胆盐能抑制革兰阳性菌，枸橼酸钠和煌绿能抑制大肠埃希菌，因而使致病的沙门菌、志贺菌容易分离到。