作为一部主打青春的电影，《五个扑水的年少》还是不可避免地将故事的背景设定在高中，尤其是高三。故事的主人公，叫张伟，是他们学校绍海三中四个张伟中的一个，是全国四十万张伟中最不起眼的那一个。

这代表着，他平凡而普通，普通到父母对他没有过高的期待，也普通到他自己习惯了普通的感觉。在学校，他经常考68分，有时进步了考个69分。

他虽然努力，但成绩却并不听他话。所以张伟对学习并不热衷，而且他讨厌自习。跟他一样讨厌自习的，还有他的同学兼死党——蛐蛐。

蛐蛐性格冲动，话多又嘴贱，就是班上那种不务正业，活泼好动的人。两个人参加了学校的游泳社团，其实只要能躲掉自习，什么社团都无所谓。

与此同时，当地准备举办高中水上运动会，要各校组建女子花样游泳队。但学校参会的老师打了个瞌睡听岔了，阴差阳错组建了男子花样游泳队。

带队的老师开始组队，但最终只有五个人。除了张伟和蛐蛐，陈铭涵、王子和高飞。

陈明涵是个学霸，因为体育挂科想通过参加体育社团躲避重修；高飞因为烧掉了老师衣服被迫加入；王子刚转学过来就想玩一下。

总之，没有一个人单纯地想练习花游。更要命的是，在训练第一天，老师脖子扭了住院了。五个少年群龙无首，张伟虽然是队长，但并没有什么主意，毕竟他是因为看起来“听话”才当选的。

青少轻狂，为了跟主任对抗，五个少年最终决定要继续练花游，给自己争一口气，他们自己在校外找了一个曾经的教练，并在他暂时废弃的海洋馆里练习。

感觉一切都在走向正轨，看起来充满希望。但教练却被爆出是个骗子，五个人开始犹豫、悔恨，也互相埋怨。在争吵中，王子受伤了，作为队长的张伟自责不已，在医院大哭，结果被人拍成视频上了热搜。

得益于此，领导开始十分重视，不仅提供场地，还专门请了专业教练悉心指导，就连之前看不起他们的同学也积极加入。终于组成了一个完整的花游队，他们不断练习，只为站上赛场，被看见，被认可。

可是，在最后关头，他们却被通知节目被砍掉……