晴空是阴影的前传，疤脸在晴空结局阻止了史小强进入核电站，但是全部人都被PSI风暴结束了姓名，疤脸被洗脑了，成为了黑石组织一员，要不然就是死了。

史小强也被洗脑，但是没有完全把记忆清除，史小强从核电站逃了出来，但自己没有记忆了，这个时候就是潜行者的CG开头，也就是开着一架车没命的逃了出来。

然后被救了，就开始了潜行者的剧情。最后又重新返回了核电站毁灭了黑石。之得一提的是，史小强很久前到达过核电站，因为PSI风暴退了出来，在晴空又到了次，潜行者结局又到了次，所以这个家伙一共去了三次核电站，而且最后毁灭了黑石，是个命大福大的人！！

他的同伴方在和鬼魂到达某目的地时中了埋伏死了，鬼魂逃脱，鬼魂后又帮助杨塔的博士，但却死在了X16地下实验室下。

另个同伴就是是跟着史小强他们一起接近核电站的博士，这个人物很神秘，游戏从头到尾没有多介绍，这个就是CG动画里那个身边有狗的博士。