自动启停系统故障的原因有以下几种：

1、原因一:一般配有自动启停功能的车辆都是默认开启启停系统的，突然不能用，有可能是误按了车上的自动启停按键，导致系统关闭。

我们检查下系统是否被关闭；

2、原因二，如果你的车是手动挡的汽车，那自动启停的启用条件会比较复杂一点，当我们停车的时候，当系统识别到"挂空挡，拉手刹，松离合，"这三个动作后才会启动；

3、原因三，各个品牌的不同车型，自动启停系统的设计也不同，以新帕萨特的自动启停系统为例，它必须要满足一定条件。即必须要安全带系上，然后第二个左前门要关闭，发动机要在启动，所以看看你的使用手册有没有什么注意事项；

4、原因四，以下这些情况下不会启动该功能，发动机未达到正常工作温度、自动空调未达到预设温度、电瓶储电量不够、停车后转动方向、车辆紧急刹车、倒车，大家可以参考以上几点；

5、原因五，自动启停系统故障，可能是因为线路，也有可能是其它原因导致启停系统工作实效，这时候最好到4S店进行检修。