工程项目经理变更流程如下：

1、拟变更工作单位的项目经理需填写《项目经理资质变更申请表》一式三份、《项目经理资质变更备案表》一式二份；

2、调出、调入单位及调出、调入单位注册所在地设区市建设行政主管部门或省级建设行政主管部门分别在《建筑业企业项目经理资质变更申请表》上相应栏目签署意见并加盖公章；

3、本人持《项目经理资质证书》原件、《项目经理资质变更申请表》一式三份、《项目经理资质变更备案表》一式二份到省建设厅办理变更手续；

4、项目经理调入单位必须是具有建设行政主管部门核发的建筑业企业资质的单位；

5、项目经理资质变更后，二年内不得再次变更工作单位；

6、非建设部、省建设厅颁发的《项目经理资质证书》不得变更。

7、一级项目经理办理变更注册手续时，除提供第三条要求的材料外，还需同时向主管部门提交与新聘用单位签订的劳动合同、新聘用单位出具的工资证明、新聘用单位为项目经理缴纳“三金”的凭证等有关证明材料，并提供原件进行核对