发酵工程是目前国际社会中最前沿的高科技领域。我们可根据它发酵的特点和微生物对氧的不同需要，将发酵分成若干类型：

1.按发酵原料来区分：糖类物质发酵、石油发酵及废水发酵等类型。

2.按发酵产物来区分：如氨基酸发酵、有机酸发酵、抗生素发酵、酒精发酵、维生素发酵等。

3.按发酵形式来区分，有固态发酵和深层液体发酵。

4.按发酵工艺流程区分，有分批发酵、连续发酵和流加发酵。

5.按发酵过程中对氧的不同需求来分，可分为厌氧发酵和通风发酵两大类型。

综上所述，我们不难发现，发酵已经从过去简单的生产酒精类饮料、生产醋酸和发酵面包发展到今天成为生物工程的一个极其重要的分支，一个包括微生物学、化学工程、基因工程、细胞工程、机械工程和计算机软硬件工程的一个多学科工程。

我们这里谈到的发酵工程，是指采用工程技术手段，利用生物（主要是微生物）和有活性的离体酶的某些功能，为人类生产有用的生物产品，或直接用微生物参与控制某些工业生产过程的一种技术。

人们熟知的利用酵母菌发酵制造啤酒、果酒、工业酒精；乳酸菌发酵制造奶酪和酸牛奶；利用真菌大规模生产青霉素等都是这方面的例子。

随着科学技术的进步，发酵技术也有了飞速的发展，并且已经进入能够人为控制和改造微生物，使这些微生物为人类生产产品的现代发酵工程阶段。

现代发酵工程不但生产酒精类饮料、醋酸和面包，而且生产胰岛素、干扰素、生长激素、抗生素和疫苗等多种医疗保健药物，生产天然杀虫剂、细菌肥料和微生物除草剂等农用生产资料，在化学工业上生产氨基酸、香料、生物高分子、酶、维生素和单细胞蛋白等。