九寨沟县原名南坪县，古称羊峒，殷商以前至秦均属氐羌。经考古调查，除草地、永和乡之外，其他乡镇均发现新石器时代遗址，可将九寨沟县历史上溯至五千年以前。

一、九寨沟县历史沿革：

　　大禹时属梁州的西北境，西汉王朝建立后，在四川北部设广汉郡，下属十三县，其中的甸氐道就是今天的九寨沟县境内，甸氐道设置是九寨沟县有史可考的最早行政管理机构，说明在2000多年前，九寨沟县及周边少数民族地区纳入到汉王朝的版图。

　　公元566年（北周武帝天和元年），吐谷浑可汗之子、龙涸王莫昌率众归附北周，北周以其地为扶州（今松潘黄龙乡），置扶州总管府，公元587年（隋文帝开皇七年）废邓州，改置扶州，将扶州由松潘黄龙乡迁至今九寨沟县安乐乡下安乐村（旧称水扶州）。

　　隋历唐至元、明，皆为扶州，城垣毁于清初“帕纳皇帝”之乱，雍正三年，清政府决定设立松潘厅南坪营，因扶州城毁坏，于是另选城址于扶州之南、西山之麓的南坪坝，至雍正七年筑成。

　　1949年12月16日南坪和平解放，1953单独建县，1998年更名为“九寨沟县”。

　　20世纪60年代以前九寨沟内只有骊道及各山间小道，藏民过着自给自足的生活，很少与外界交往，因而九寨沟一直不为人知。

　　1966年大队人马开进九寨沟，开始砍伐森林，九寨风光面临毁灭的危险。

　　1978年11月30日有关部门下令停止在九寨沟采伐木材。

　　1978年12月15日国务院正式下达文件，批转国家林业总局《关于加强大熊猫保护、驯养工作的报告》，批准建立九寨沟国家级自然保护区。

　　1979年进驻九寨沟的两个林场迁出。1980年九寨沟自然保护区管理处成立。

　　1982年国务院批准九寨沟为国家级风景名胜区。

　　1984年九寨沟风景名胜区管理局成立。

　　1990年进沟旅游人数突破15万，其中外宾和港、澳、台游客逾7000人。

　　1992年12月14日经联合国教科文组织世界自然遗产委员会全委会第16届大会表决一致通过，将九寨沟列入《世界自然遗产名录》。

　　1998年6月更名为九寨沟县，县城置永乐镇。