1、细胞计数法

计数板计数法：混匀藻液，取出一定量的藻液，滴入一滴甲醛固定扁藻细胞，用血球计数板计数，每个样品须重复测定3次，计算每毫升藻液所含细胞数的平均值。

每毫升藻液所含的细胞数（细胞密度）按下式计算：

每毫升藻液细胞数＝计数平均值×10，000×稀释倍数 （2-1）

2、干重法

取一定体积的藻液，用玻璃纤维滤纸（Whatman GF/C）过滤获得藻细胞沉淀，将沉淀放入80℃烘箱中烘干至恒重，称量，藻细胞的质量即等于称量结果减去滤纸的质量。

3、光密度法

混匀藻液，取3 ml藻液放入1 cm光径比色皿中，以不含扁藻细胞的培养基为空白对照，在Jasco V-530型紫外可见分光光度计下取其特征吸收峰测定OD值（绿藻一般为680，665，450 nm）。

先稀释出不同浓度的藻液，用分光光度计测定其吸光度值，然后根据各组数据生成工作曲线，之后就只用测吸光度了。关键还是要选择合适的波长，培养液最好不要有杂色。

硅藻含类胡萝卜素较多，用440nm就可以。