呼伦贝尔市辖2个区，分别是海拉尔区（面积1320平方公里）和扎赉诺尔区（面积279.5平方公里）。

4个旗，分别是阿荣旗（面积13641平方公里）、陈巴尔虎旗（面积21192平方公里）、新巴尔虎左旗（面积2.2万平方公里）和新巴尔虎右旗（面积 25194 平方公里）。

3个自治旗，分别是莫力达瓦达斡尔族自治旗（面积约1.1万平方公里）、鄂伦春自治旗（面积59800平方公里）和鄂温克族自治旗（面积19111平方公里）；

没有辖县。

1、市辖区

（1）海拉尔区

内蒙古自治区呼伦贝尔市的市辖区之一，位于内蒙古自治区东北部，地理坐标位于东经119°28′~120°34′与北纬49°06′~49°28′之间 ，面积1320平方公里。

（2）扎赉诺尔区

简称扎区，是内蒙古自治区呼伦贝尔市辖区，由满洲里市代管，西北靠满洲里市区，辖5个街道、1个镇，总面积279.5平方公里。

2、旗

（1）阿荣旗

位于大兴安岭东麓，阿荣旗南北长151.9km，东西宽149.6km，总面积13,641平方公里。

（2）陈巴尔虎旗

位于中国内蒙古自治区呼伦贝尔市西北部，该旗土地面积21192平方公里。

（3）新巴尔虎左旗（又称东旗，新左旗）

地处大兴安岭北麓，呼伦贝尔市西南端，土地面积2.2万平方公里。

（4）新巴尔虎右旗（简称新右旗）

呼伦贝尔市西部中俄蒙三国交界处，东北部与全国最大的陆路口岸城市满洲里毗邻新巴尔虎右旗总面积 25194 平方公里。

3、自治旗

（1）莫力达瓦达斡尔族自治旗（简称莫旗）

莫旗位于内蒙古自治区呼伦贝尔市最东部、大兴安岭东麓中段、嫩江西岸。全境南北长203.2公里，东西长125公里，面积约1.1万平方公里。

（2）鄂伦春自治旗

位于呼伦贝尔市东北部，大兴安岭南麓，嫩江西岸，全旗总面积59800平方公里。是呼伦贝尔市面积最大的旗（市）。

（3）鄂温克族自治旗

位于内蒙古自治区东北部，大兴安岭西侧、呼伦贝尔大草原东南部，土地总面积19111平方公里。