济源有两级法院，即济源市中级人民法院和济源市人民法院，按地级市标准配备法院机构，所以法院有两个。

一、济源市中级人民法院

2001年8月21日，最高人民法院批准成立河南省济源市中级人民法院。2003年3月5日，经最高人民法院批准河南省济源市中级人民法院更名为河南省济源中级人民法院。

2003年4月22日，河南省济源中级人民法院挂牌成立，下辖一个基层人民法院（济源市人民法院）。

济源中级人民法院内设办公室、政治部、立案庭、刑事审判第一庭、民事审判第一庭、民事审判第二庭、民事审判第三庭（知识产权庭）、行政审判庭、执行局、审监庭、司法警察支队、司法技术鉴定处、司法行政装备处、监察室、研究室、赔偿委员会办公室、审判管理办公室等17个部门。

二、济源市人民法院

作为济源市的基层法院，济源市人民法院负责审理执行济源市辖区内的一审民商事、刑事和行政案件。她始建于1945年的济源县抗日政府政府司法科，内设机构18个：政治处、办公室、立案庭、审判管理办公室、刑事审判庭、民事审判第一庭、第二庭、行政审判庭、审判监督庭、执行局、政策研究室、监察室、司法警察支队、司法装备科以及第一、二、三、四中心法庭。

2014年元月，济源市人民法院从天坛路搬迁到汤帝路后，总占地19.5亩，新投入办公使用的两级法院综合楼1-9楼和诉讼服务中心，建筑面积7000余平方米，设施完备，配套完善，基本满足现代化审判的要求。

另外，济源检察院也是两级，即济源市人民检察院和济源检察分院。